يهدف الجزء النظري من المساق إلى توضيح المتطلبات الميكروبولوجيه للمواد الغذائية وإدارة وتشغيل مختبرات التحاليل الميكروبولوجيه وطرق تحضير وسائط الزراعة للعينات وطرق فحص التلوث الميكروبي للأغذية. أما بالنسبة للجزء العملي فيتضمن طرق أخذ العينات وطرق التعرف على الميكروبات الضارة في الأغذية والتدريب العملي على فحص عينات من مختلف أنواع المواد الغذائية مثل اللحوم والألبان والخضار والفواكه والمشروبات.